промежуточный. нашел еще баг построения деревьев версий.

.idea/workspace.xml

@@ -6,9 +6,7 @@
     </artifacts-to-build>
   </component>
   <component name="ChangeListManager">
-    <list default="true" id="e42177c3-2328-4b27-8a01-35779b2beb99" name="Default Changelist" comment="">
-      <change beforePath="$PROJECT_DIR$/src/Repository/Component/Visualiser.java" beforeDir="false" afterPath="$PROJECT_DIR$/src/Repository/Component/Visualiser.java" afterDir="false" />
-    </list>
+    <list default="true" id="e42177c3-2328-4b27-8a01-35779b2beb99" name="Default Changelist" comment="" />
     <option name="SHOW_DIALOG" value="false" />
     <option name="HIGHLIGHT_CONFLICTS" value="true" />
     <option name="HIGHLIGHT_NON_ACTIVE_CHANGELIST" value="false" />

src/SapforTestingSystem/PerformSapforTask.java

@@ -314,7 +314,8 @@ public class PerformSapforTask extends Pass_2021<SapforTask> {
         project.CreateVisualiserData();
         //---
         if (isTransformation && !messages.isEmpty()) {
-            project.Open();
+            project.Open(); //нельзя!!! сначала надо определиться с версиями. И только потом, получать файлы.
+            //а так же, убрать dep и txt
             project.db.BeginTransaction();
             for (MessageError m : messages) {
                 if (project.db.files.containsKey(m.file)) {
@@ -344,10 +345,12 @@ public class PerformSapforTask extends Pass_2021<SapforTask> {
     }
     @Override
     protected void performFinish() throws Exception {
+        /*
         //теперь строим деревья версий. нельзя делать в body. так как могут быть исключения например неверный код процесса.
         for (SapforVersion_json version : target.versions)
             createVersionProjectData(version, true);
         for (SapforVersion_json version : target.variants)
             createVersionProjectData(version, false);
+         */
     }
 }